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circRNA研究匯總 | 20200203-0209
來源: | 作者:geneseed | 發布時間: 2020-02-10 | 575 次瀏覽 | 分享到:

歡迎各位來到“circRNA研究報道匯總”欄目,本期從pubmed中檢索收集最新發布的circRNA文獻共計36篇,下面我們一起來看看,circRNA研究最近有哪些新進展。

檢索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract] 



1circSamd4抑制PUR蛋白的成肌轉錄活性。

標題:circSamd4 represses myogenic transcriptional activity of PUR proteins.

雜志:Nucleic Acids Res. 

影響因子:11.147

通訊作者:Myriam Gorospe (美國NIH國家衰老研究所)


許多與年齡相關的慢性肌肉骨骼疾病,包括肌少癥,骨關節炎,慢性心力衰竭和慢性阻塞性肺疾病,都與異常的肌肉發生有關。該文研究者先前發現隨著年齡的增長,猴子骨骼肌中的circRNA表達發生變化,并提出其中一些circRNA可能會影響衰老過程中的肌肉功能。在這篇論文中,作者采用RNA測序分析鑒定了在肌肉分化過程中差異表達并在人類肌肉細胞中保守的circRNA--circSamd4,小鼠C2C12細胞在分化為肌管過程中,circSamd4表達水平顯著增加,此外,沉默circSamd4后可延緩成肌過程并降低成肌標記物的表達。對circSamd4的Pulldown產物質譜分析發現,circSamd4與PURA和PURB相關,這兩個肌發生抑制因子可抑制肌球蛋白重鏈(MHC)蛋白家族的轉錄。沉默circSamd4可以增強PUR蛋白與Mhc啟動子的結合,而過表達circSamd4則會干擾PUR蛋白與Mhc啟動子的結合。當使用缺少PUR結合位點的circSamd4突變體時,這些作用將被消除。該結果表明,PUR蛋白與circSamd4的締合通過促成MHC的轉錄抑制而增強肌肉發生過程。


圖注:circSamd4與PUR蛋白相互作用


2、lncRNA和circRNA編碼多肽的腫瘤相關新功能。

標題:Emerging role of tumor-related functional peptides encoded by lncRNA and circRNA.

雜志:Molecular Cancer

影響因子:10.679

通訊作者:熊煒教授(中南大學腫瘤研究所)


通常認為非編碼RNA不編碼蛋白質,在腫瘤發展過程中主要起基因調控功能,它們也是重要的癌癥診斷和預后生物標志物。但隨著研究的推進,生物信息學和翻譯組學已經開始闡明ncRNA編碼的功能肽的作用和作用方式。這篇綜述匯總了長非編碼RNA(lncRNA)和環狀RNA(circRNA)編碼的小肽的最新進展。作者介紹了預測ncRNA編碼腫瘤功能多肽的計算和分析方法,還介紹了許多特定的lncRNA和circRNA編碼的蛋白,以及它們促進癌癥或抑制癌癥的分子機制。這些非編碼RNA翻譯功能多肽的研究信息和思路可能加快發現、開發和優化基于癌癥的新型診斷,治療和預后蛋白質有效的工具。ncRNA編碼功能肽的作用在癌癥研究中具有廣闊的應用前景。這篇綜述的目的是促進發現由ncRNA編碼的更多功能性肽提供理論基礎和相關參考,并進一步開發新的抗癌治療靶標以及診斷和預后標志物。


圖注:一些特定circRNA和lncRNA編碼多肽的腫瘤功能


3、circRIP2通過miR-1305 /Tgf-β2/ smad3途徑加速膀胱癌的進展。

標題circRIP2 accelerates bladder cancer progression via miR-1305/Tgf-β2/smad3 pathway.

雜志:Molecular Cancer

影響因子:10.679

通訊作者:林天歆和黃健教授(中山大學孫逸仙紀念醫院)


環狀RNA在癌癥中的研究主要分為兩個部分,一個是確定其是否有致癌作用,另一個是證明其作為生物標志物的應用。在膀胱癌中,ciRS-7可通過升高p21來抑制膀胱癌的生長。缺氧誘導circELP3的升高可促進膀胱癌的進展和耐藥性;環狀RNA CEP128通過調節MAPK信號傳導促進膀胱癌細胞的增殖和遷移;circHIPK3通過抑制乙酰肝素酶的表達減少肺轉移。此外,作為生物標志物,血清和尿液中外泌體中的circPRMT5上調與膀胱癌患者的轉移呈正相關。circ-ITCH 和circHIPK3 在膀胱癌組織中表達較低,并且與膀胱癌患者的分級,分期以及淋巴結轉移呈負相關。綜上所述,這些結果暗示了環狀RNA在調節膀胱癌行為中的重要作用,并可作為膀胱癌的新型生物標志物。為了鑒定膀胱癌中更多的環狀RNA,該研究重新分析了先前在2對成對的膀胱癌組織中的RNA-seq測序數據,發現circRIP2在膀胱癌組織中顯著下調,并且與膀胱癌的分級,分期,轉移以及患者預后更好相關。體外和體內研究表明,circRIP2通過Tgf-β2/ smad3刺激的EMT途徑促進膀胱癌的增殖,侵襲和遷移。簡而言之,該研究提供了第一個證據,證明circRIP2在膀胱癌中差異表達,并可預測癌癥進展。有效的circRIP2活性通過激活miR-1305 /Tgf-β2/ smad3途徑誘導EMT來加速膀胱癌的發展。該研究表明,circRIP2可能是膀胱癌患者的潛在生物標志物和治療靶標。



圖注:circRIP2在膀胱癌中表達及預后情況




參考文獻列表

序號

主要內容

論文標題

雜志

IF

單位

1

UPF1和G3BP1通過結構介導的RNA衰減。

Structure-Mediated RNA Decay by UPF1 and G3BP1.

Mol Cell

14.548

約翰斯·霍普金斯大學

2

circSamd4抑制PUR蛋白的成肌轉錄活性。

circSamd4 represses myogenic transcriptional activity of PUR proteins.

Nucleic Acids Res.

11.147

美國國立衛生研究院

3

lncRNA和circRNA編碼多肽的腫瘤相關新功能。

Emerging role of tumor-related functional peptides encoded by lncRNA and circRNA.

Mol Cancer

10.679

中南大學腫瘤研究所等

4

circRIP2通過miR-1305 /Tgf-β2/ smad3途徑加速膀胱癌的進展。

circRIP2 accelerates bladder cancer progression via miR-1305/Tgf-β2/smad3 pathway.

Mol Cancer

10.679

中山大學孫逸仙紀念醫院

5

環狀非編碼RNA NR3C1充當miR-382-5p海綿,通過調節PTEN/AKT/mTOR信號通路來保護RPE功能。

Circular Noncoding RNA NR3C1 Acts as a miR-382-5p Sponge to Protect RPE Functions via Regulating PTEN/AKT/mTOR Signaling Pathway.

Mol Ther

8.402

南京醫科大學附屬第一醫院

6

Circ-calm4可作為miR-337-3p海綿來調節Myo10(肌球蛋白10)并促進肺動脈平滑肌增殖。

Circ-calm4 Serves as an miR-337-3p Sponge to Regulate Myo10 (Myosin 10) and Promote Pulmonary Artery Smooth Muscle Proliferation.

Hypertension

7.017

哈爾濱醫科大學等

7

CircAST:環狀RNA中全長剪接異構體的全長組裝和定量。

CircAST: Full-length Assembly and Quantification of Alternatively Spliced Isoforms in Circular RNAs.

Genomics Proteomics Bioinformatics

6.597

南京航空航天大學

8

外泌體傳遞的環狀RNA hsa_circ_0051443抑制肝細胞癌的進展。

Exosome-transmitted circular RNA hsa_circ_0051443 suppresses hepatocellular carcinoma progression.

Cancer Lett

6.508

中山大學孫逸仙紀念醫院等

9

circATRNL1的上調導致口腔鱗狀細胞癌對輻射敏感。

Upregulation of Circular RNA circATRNL1 to Sensitize Oral Squamous Cell Carcinoma to Irradiation.

Mol Ther Nucleic Acids

5.919

中山大學附屬口腔醫院

10

睪丸活組織檢查中微陣列分析顯示circRNA參與了非阻塞性無精子癥的發病機制。

Testicular biopsies microarray analysis reveals circRNAs are involved in the pathogenesis of non-obstructive azoospermia.

Aging (Albany NY)

5.515

中南大學基礎醫學院

11

鹽酸異丙腎上腺素誘導的心肌肥大中的環狀RNA表達。

Circular RNA expression in isoproterenol hydrochloride-induced cardiac hypertrophya.

Aging (Albany NY)

5.515

北京大學第三醫院等

12

秀麗隱桿線蟲的全轉錄組調控與線粒體多態性和衰老有關。

The whole transcriptome regulation as a function of mitochondrial polymorphisms and aging in Caenorhabditis elegans.

Aging (Albany NY)

5.515

徐州醫科大學

13

使用逆轉錄-滾環擴增法直接檢測現實樣品中的circRNA。

Direct detection of circRNA in real samples using reverse transcription-rolling circle amplification.

Anal Chim Acta

5.256

武漢大學生物醫用高分子材料教育部重點實驗室

14

基于環狀RNA circPDK1的肺鱗癌切除預后模型。

Prognostic model based on circular RNA circPDK1 for resected lung squamous cell carcinoma.

Transl Lung Cancer Res

4.806

青島大學附屬醫院

15

Circ-ZKSCAN1通過靶向miR-330-5p調節FAM83A表達并失活MAPK信號傳導來促進非小細胞肺癌的發展。

Circ-ZKSCAN1 regulates FAM83A expression and inactivates MAPK signaling by targeting miR-330-5p to promote non-small cell lung cancer progression.

Transl Lung Cancer Res

4.806

青島大學附屬醫院

16

CircPRMT5通過海綿化miR-377誘導E2F3表達來促進結直腸癌的增殖。

CircPRMT5 circular RNA promotes proliferation of colorectal cancer through sponging miR-377 to induce E2F3 expression.

J Cell Mol Med

4.658

四川大學華西公共衛生學院

17

在自閉癥譜系障礙的BTBR小鼠模型海馬組織中環狀RNA的差異表達。

Differential Expression of Hippocampal Circular RNAs in the BTBR Mouse Model for Autism Spectrum Disorder.

Mol Neurobiol

4.586

羅馬薩皮恩扎大學

18

circ-CEP85L通過miR-942-5p調節NFKBIA表達,從而抑制胃癌的增殖和侵襲。

circ-CEP85L suppresses the proliferation and invasion of gastric cancer by regulating NFKBIA expression via miR-942-5p.

J Cell Physiol

4.522

福建醫科大學附屬協和醫院

19

環狀RNA CDR1as在類固醇誘導的股骨頭壞死中促進脂肪形成并抑制BMSC的成骨分化。

Circular RNA CDR1as promotes adipogenic and suppresses osteogenic differentiation of BMSCs in steroid-induced osteonecrosis of the femoral head.

Bone

4.36

吉林大學第二醫院

20

整合重啟式隨機游走和k最近鄰算法識別新型circRNA-疾病關聯。

Integrating random walk with restart and k-Nearest Neighbor to identify novel circRNA-disease association.

Sci Rep

4.011

陜西師范大學計算機科學學院

21

circRNA_100290的過表達通過miR-136-5p/RAP2C軸促進喉鱗狀細胞癌的進展。

Overexpression of circRNA_100290 promotes the progression of laryngeal squamous cell carcinoma through the miR-136-5p/RAP2C axis.

Biomed Pharmacother

3.743

首都醫科大學附屬北京友誼醫院

22

膀胱癌circRNA-miRNA-mRNA調控網絡潛在功能鑒定,助于發病機理和可能生物標記研究。

Identification of a potentially functional circRNA-miRNA-mRNA regulatory network for investigating pathogenesis and providing possible biomarkers of bladder cancer.

Cancer Cell Int

3.439

南京醫科大學附屬第一醫院

23

circGFRA1通過海綿化miR-188-3p增強NSCLC進程。

circGFRA1 Enhances NSCLC Progression by Sponging miR-188-3p.

Onco Targets Ther

3.046

浙江樂清市人民醫院

24

circHUWE1被上調并通過miR-486促進結直腸癌中的細胞增殖,遷移和侵襲。

Circular RNA circHUWE1 Is Upregulated and Promotes Cell Proliferation, Migration and Invasion in Colorectal Cancer by Sponging miR-486.

Onco Targets Ther

3.046

首都醫科大學附屬北京朝陽醫院

25

血漿circBNC2作為上皮性卵巢癌診斷生物標志物的實用性。

Utility Of Plasma circBNC2 As A Diagnostic Biomarker In Epithelial Ovarian Cancer.

Onco Targets Ther

3.046

北京協和醫學院

26

circHIAT1通過下調miR-21抑制胃癌細胞系的增殖和上皮-間質轉化。

Circular RNA circHIAT1 inhibits proliferation and epithelial-mesenchymal transition of gastric cancer cell lines through downregulation of miR-21.

J Biochem Mol Toxicol

2.965

解放軍海軍第971醫院

27

miRNA,lncRNA和circRNA可調控小鼠黑素細胞和皮膚發育。

The comprehensive detection of miRNA, lncRNA, and circRNA in regulation of mouse melanocyte and skin development.

Biol Res

2.482

山西農業大學

28

低表達的circPVT1通過microRNA-3666下調SIRT7來限制肝細胞癌的細胞生長。

Downregulation of circular RNA circPVT1 restricts cell growth of hepatocellular carcinoma through downregulation of SIRT7 via microRNA-3666.

Clin Exp Pharmacol Physiol

2.336

西安交通大學附屬第二醫院

29

UBAP2的抑制通過microRNA-422a/Rab10軸抑制食管鱗狀細胞癌的惡性行為。

Knockdown of circular RNA UBAP2 inhibits the malignant behaviors of esophageal squamous cell carcinoma by microRNA-422a/Rab10 axis.

Clin Exp Pharmacol Physiol

2.336

陜西省人民醫院

30

環狀RNA HIPK3通過使miR-338-3p海綿化以上調HIF-1α來促進宮頸癌的EMT。

Circular RNA HIPK3 Promotes EMT of Cervical Cancer Through Sponging miR-338-3p to Up-Regulate HIF-1α.

Cancer Manag Res

2.243

連云港市第一人民醫院

31

circRNA_104433通過靶向miR-497-5p調控胃癌中的細胞生長。

Circular RNA Profiling Reveals That circRNA_104433 Regulates Cell Growth by Targeting miR-497-5p in Gastric Cancer.

Cancer Manag Res

2.243

廣西醫科大學附屬腫瘤醫院

32

circMAN2B2通過下調miR-145促進胃癌細胞的生長和遷移。

Circular RNA circMAN2B2 promotes growth and migration of gastric cancer cells by down-regulation of miR-145.

J Clin Lab Anal

1.728

解放軍海軍第971醫院

33

cirRNA在生殖細胞發育中的作用。

The roles of cirRNA in the development of germ cells.

Acta Histochem

1.719

桂林醫科大學

34

母體胎兒來源的circRNA的差異表達譜研究和基因功能分析用于篩查唐氏綜合癥。

Differential expression profile study and gene function analysis of maternal foetal-derived circRNA for screening for Down's syndrome.

Exp Ther Med

1.448

解放軍聯勤保障部隊第924醫院

35

通過測序分析鑒定潛在的與脊髓損傷相關的環狀RNA-microRNA網絡。

[Identification of potential traumatic spinal cord injury related circular RNA-microRNA networks by sequence analysis].

Zhongguo Xiu Fu Chong Jian Wai Ke Za Zhi

Not Found

四川大學華西醫院

36

環狀RNA與心血管疾病關系的研究進展

[Research progress on the relationship between circular RNA and cardiovascular diseases].

Zhonghua Xin Xue Guan Bing Za Zhi

Not Found

中山大學附屬第八醫院


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